Добрый день! Вы действительно приняли человека на работу, и эту запись не аннулируют и не исправляют. В таком случае - это обычное увольнение. Неважно, сколько дней он проработал.
Внесите запись об увольнении по собственному желанию. Отрабатывать в этом случае ему не обязательно. Если руководство отпускает - можно уволиться и одним днем.
Примеры записей о приеме на работу, увольнении, переводе и совмещении можно посмотреть тут:
http://www.glavbukh.ru/tk/