такого быть не должно, если такое происходит, особенно если оно, как ты написал ЗАМЕТНО отличается, то на это может быть несколько причин:
если в проекте производилось перемещение аудиосэмплов выше или ниже по тональности от их первоначальной высоты тона, то звучание после экспорта может немного отличаться от того, что звучит в проекте при создании
что бы оно не отличалось, в настройках "Options > Audio Settings" в разделе "Mixer > Resamling quality", и в настройках экспорта в разделе "Quality > Resampling" должны стоять одинаковые значения
что это такое, и на что влияет почитать можно тут:
http://wikisound.org/Fl_Studio_Настройки_Audioв разделе ниже "Mixer (микшер) "
и тут:
http://wikisound.org/FL_Studio_Сохраняемые_и_экспортируемые_форматы_файловв разделе ниже "Quality (качество) "
______________________________________
насчёт дизеринга - это простое подмешивание шума, иногда, и в какой то мере оно влияет на качество, но на микроуровне, на слух это почти неуловимо, поэтому как то кардинально улучшить качество оно не может
насчёт того, что тебе написали что MP3 убивает качество - это так, но это касается только MP3 с низким битрейтом, MP3 с высоким битрейтом 320 kbps практически идентично на слух с WAV, и в честном слепом тесте, я более чем уверен, что 99% людей не различит MP3 320 kbps от WAV
______________________________________
есть ещё несколько нюансов, почему качество после экпорта может отличаться, допустим редко, но бывает так, что некоторые плагины могут вести себя (звучать) немного некорректно после экпорта, пару раз я встречал такие, решалось это то ли установлением нужных галочек в настройках Wrapper (в оболочке плагинов), то ли в самом плагине в его настройках, забыл уже
http://wikisound.org/Fl_Studio_Оболочка_плагиновещё бывает так, что некоторые плагины в режиме экспорта переходят в режим максимального качества, у некоторых плагинов есть функция настройки, которая отвечает за это, и можно самому указать, будет ли он переходить в другой режим после экпорта, или не будет
______________________________________
P.S. вообще, лучше сохранять в WAV, и после сохранения конвертировать каким нибудь хорошим и проверенным сторонним кодировщиком в MP3 320 kbps