однозначно вирус.
Загрузите бесплатную лечащую утилиту Dr.Web CureIt -
http://www.freedrweb.com/cureit/?lng=ru или Dr.Web LiveCD -
http://www.freedrweb.com/livecd/ или
http://z-oleg.com/secur/avz/index.php и прогоните комп с их помощью.
Ещё можно диск вытащить из комп-а, подключить ведомым к другому комп-у (с хорошим антивиром) и вылечить от вирусов.
ps. скорей всего, эти файлы и папки не стёрлись, просто у них изменились свойства на "Скрытый". Эту фишку любят делать авторан-вирусы.