Какую программу сложнее всего написать с нуля?

Игру

игру кончено

Подари лючи

Тебе будет сложно написать большинство

Если имеется в виду именно программу где ты только программированием занимаешься (а не разрабатываешь игры, где надо проектировать смену спрайтов, движения обработку событий и т.д)
То сложнее всего на мой взгляд с нуля написать обычный чат между двумя людьми, так что бы и история переписки сохранялась, и метка прочитано ли сообщение и т.д.
Придётся подумать над многими моментами и о том как хранить данные и как сообщения отображать асинхронно для пользователей

сложную игру

компилятор для с++

"с нуля" не может быть различий и альтернатив - никакую
Кактусиха местный инфоцыган. Генерирует абсолютно бесполезный контент