удалите все разделы из линукс с помощью cfdisk или fdisk(!!если конечно у Вас нет важных данных!!!) . Затем загружайтесь с загрузочного диска windows и создавайте разделы..
Я бы поступил так: Поставил Acronis Disk Director Suite 10_RUS, записал им загрузочный диск. Загрузился бы с него, удалил нафиг разделы и потом тут же отформатировал в НТФС.
Загрузочный LiveCD построенный на основе BartPE и Windows 2003 Ent Server. Содержит программы для резервирования и восстновления операционных систем, разметки и редактирования разделов и дисков. Лечения вирусов. Возможность работать с разделами FAT, FAT32, NTFS.
проще удалить и на удаленный диск ставить винду она сама всю работу за вас сделает и без акрониса ето бред сивой кобылы, вы хотите спилить сук на котором сидите ))))