что будет если отформатировать диск С (на диске D есть ещё оперционная система)

Скорее всего операционная система на D перестанет загружаться и понадобится восстановить загрузчик.

Ничего не будет... вообще ни чего... никакой операционной системы. Винда тебе не даст его отфарматировать

Отфорформатируется в формате, который выбирает пользователь по своему желанию!

просто банка не загрузится, да и впринципе комп тебе не даст отформатировать если будет загружен.

по идее ничего страшного не будет, только в биосе нужно изменить настройки (указать диск Д как главный) , но рекомендую сначала загрузиться с Д а потом форматировать!

тогда в биос укажи загрузку с диска D

Загружайся с диска D....и форматируй диск С.... предварительно удали разделы диска С.

Увы, в вопросе не указано, С и D - это два разных накопителя или два логических дисков на одном накопителе.
Если разные - второй диск никак не пострадает.
Если на одном - система с диска D загружаться не сможет (вне зависимости от установок BIOS), т. к. загрузчик в любом случае располагает в первом разделе диска.