почему не всегда ставится запятая перед союзными словами

Из вопроса не совсем ясно, что Вы имеете в виду. Союзные слова употребляются для связи простых предложений в сложноподчинённом, и в таком случае запятая ставится обязательно. Другое дело, что может быть предложение такого типа: ТОЛЬКО ТЕПЕРЬ МЫ ВСПОМНИЛИ ЧЕЛОВЕКА, НА СЛОВА КОТОРОГО ВНАЧАЛЕ НЕ ОБРАТИЛИ ВНИМАНИЯ. Союзное слово КОТОРОГО стоит не в начале придаточного, поэтому запятая стоит на границе предложений, а не перед союзным словом. Как правило, союзные слова стоят в начале придаточного, поэтому запятая оказывается перед С. С. , хотя ставится она не потому, что есть союзное слово, а потому что ГРАНИЦА ПРЕДЛОЖЕНИЙ.