В версии Indesign CS2, колонтитул делают в ручную на Мастер-странице. А в версиях CS3 и CS4 уже можно делать скользящие колонтитулы! Установку колонтитула см. фото и читай Help (кнопки: F+1), там, в Help, есть подробное описание с видео уроками! И не забудь прочитать какую -либо книгу, по правилам набора и верстки публикаций, т. к. создание колонтитулов строго регламентировано и требует специальных знаний!
Удачи!