Так сложилось исторически.
То есть изначально не было никакой нашей или ненашей эры, счет времени вели в каждой стране по-своему, часто деля время по периодам правления царей. Но с появлением христианства христианские деятели постановили, что теперь наступила новая эра, так как "Господь заключил новый завет с людьми", а поэтому необходимо и счет времени привязать к этому событию. Ну, а уж потом для обозначения событий, произошедших ранее рождения Христа, стали использовать формулировку "до нашей эры".
Наша эра, н. э. (альтернативная расшифровка новая эра, англ. Common Era, англ. CE) — период времени начиная с 1 года по Григорианскому календарю, текущая эпоха. Период времени, заканчивающийся до начала первого года по Григорианскому календарю — до нашей эры, до н. э. ; альтернативная форма До Рождества Христова.
Название часто используются в религиозной форме «от Рождества Христова» , сокращённая запись — «от Р. Х.» . Подобная запись хронологически эквивалентна (не требуется конвертации или введения нулевого года) .
Нулевой год не используется ни в светской, ни в религиозной нотациях — так было заведено Бедой Достопочтенным в начале VIII века (ноль тогда вообще не был распространён в культуре) . Однако нулевой год применяется в астрономической записи (англ. Astronomical year numbering) и в стандарте ISO 8601.
По мнению большинства учёных, при вычислении в VI веке римским игуменом Дионисием Малым года Рождества Христова, была сделана небольшая ошибка (в несколько лет).
Эра "от Рождества Христова"была введена Дионисием Малым в 525 году, уже в начале VII века была утверждена папой Римским Бонифацием IV. Она встречается и в документах папы Иоанна XIII (965 - 972 гг.) . Но лишь со времени Евгения IV, с 1431 года, данная эра применяется в документах канцелярии Ватикана регулярно. Одновременно в обязательном порядке должен был указываться и год от сотворения мира.
Вскоре после введения эра была использована также и некоторыми западными историками и писателями, в частности, современником папского архивариуса Марком Аврелием Кассиодором, столетием позже - Юлианом Толедским, затем - Бедой Достопочтенным.
На протяжении VIII - IX веков новая эра получила широкое распространение во многих государствах Западной Европы.
В России христианское летосчисление и январское новолетие, как уже говорилось, было введено в конце 1699 года указом Петра I, по которому (лучшего ради согласия с народами европейскими в контрактах и трактатах ( год, начинавшийся после 31 декабря 7208 года от сотворения мира, стал считаться 1700 годом от Рождества Христова.
К настоящему времени эра "от Рождества Христова", созданная Дионисием Малым более полутора тысячелетия тому, "стала как бы абсолютной шкалой для фиксирования исторических событий во времени" (Е. И. Каменцева. Хронология. - М. : "Высшая школа", 1967. - С. 24).
http://www.astrolab.ru/cgi-bin/manager.cgi?id=34&num=322