Как узнать свою задолженность по ИП (Налог 2012 год)?

А какое письмо из налоговой Вы ждете?
Налоговая инспекция за Вас рассчитывает только те налоги, которые Вы обязаны уплатить как физическое лицо: транспортный, земельный, налог на имущество физических лиц. Вот по ним задолженность Вы можете узнать на сайте налоговой инспекции в сервисе "Узнай свою задолженность".
Остальные налоги, связанные с деятельностью в качестве предпринимателя, Вы должны исчислять и уплачивать сами - в зависимости от выбранной системы налогообложения заполняете декларации и представляете их в налоговую инспекцию, а налог, который по ним рассчитан - уплачиваете (квитанцией, которую заполняете сами), или платежным поручением через банк - опять таки заполненной самим).
Если Вы декларации не сдавали, то как налоговая инспекция узнает, сколько Вы должны платить?
А если сдавали, то сумму налога Вы знаете прекрасно. Можете только сверить ее с налоговой инспекцией и узнать свой долг, заказав справку о состоянии расчетов с бюджетом - другого варианта узнать задолженность ИП пока не существует.

Что касается задолженность в государственные внебюджетные фонды, то узнать ее сумму Вы можете, обратившись в Пенсионный фонд. Если взносы в 2012 году Вы вообще не уплачивали и наемных работников у Вас не было, то эта сумма фиксирована. За весь год она составляет:
- в Пенсионный фонд 14 386,32 рубля
- в фонд обязательного медицинского страхования - 2 821,93 рубля.
Если ИП зарегистрировано не с начала года, то меньше. Но узнать это, опять же можно только, обратившись в Пенсионный фонд.
В другие фонды Вы за себя взносы не уплачиваете.