Нужно создать так называемый контекстный скрипт (context_script).
Это скрипт, который будет вставляться в посещаемые страницы. (Заметим, что в коде страницы этого скрипта видно не будет, что иногда полезно. )
Вот пример, вставляющий в страницы баннер с логотипом яндекса.
manifest.json
http://pastebin.com/pzgERicC script .js
http://pastebin.com/wQ67PNhL По расширениям рекомендую сайт
http://developer.chrome.com/extensions/ Он англоязычный, но в нём есть описания все Chrome API (в том числе новейших вроде chrome), и изложена инфа вполне прилично.
Не путайте плагины с расширениями.
Плагин пишут на компилируемом ЯП в виде DLL, а расширение на JSON и JS.
Но расширение может включать в себя плагины для обеспечения расширенного доступа к компу.