Налогооблагаемая база. Термин

куда ты лезешь, необразованный, с 9-ю классами ......

Доход при УСН считается, от суммы оплаты которую заплатил покупатель за ваш товар маркетплейсу. Так как маркетплейс работает с вами по договору комиссии. Комиссионер должен направить вам отчет комиссионера о продажах за период- из него виден ваш доход при УСН. там же в отчете должна быть сумма комиссионного вознаграждения.
А то что, позднее маркетплейс переведет вам сумму уже за минусом комиссионного вознаграждения. Если только ее отразите в доходах от продаж через маркетплейс, то ФНС при проверке вас накажет за занижение базы доходов при УСН.
Т.е. если продали за 5тыс. то с них налог по УСН с дохода 6 % 5т*0,06=300 рублей.
Официальным документом по подтверждению дохода в данном случае является отчет комиссионера по продажам ваших товаров за период, а не то что вам поступило на р/счет от комиссионера.

когда вы выбирали УСН 6%, вы о чем думали?
купили товар за 2000, продали за 5000, заплатили за продажу 500
с какой суммы будете платить 6%?
с 5000