сушествуют программы (не сами антивирусы, а лишь часть от неё) которые только проверяют операционную систему. Их можно скачать с интернета, например Cureit от антивируса Dr. Web
www.izone.ru/security/antiviruses/dr-web-cureit.htm от сюда его можно скачать.. .Удачи!
P.S. Поставьте себе анти вирус с постоянным сканированием.