влияет ли фрагментация на скорость работы компа и программ?

Конечно, скорость доступа к тем или иным файлам и папкам снижается, так как части этих файлов или папок находится в разных кластерах и головка жёсткого диска передвигается от одного кластера к другому, следовательно на это уходит больше времяни. Это в том случае если уж сильно фрагменировано.