Как эту фразу понимать "Али есть то место, али его нет"

Либо место то есть, либо его нет.

Вроде есть то место, а вроде его нет.

С восточного. Так проще для русской рифмофки.

и кто его знает (а кто его знает)...

Али есть то место, али его нет=Или есть то место, или его нет

Союз "или" употребляемый в форме "али", "аль" означает добавление вопросительной интонации к предложению. Может быть употреблён как вопросительное к одному единственному аргументу, без перечисления.
"Али это Фёдор был? " = "Не Фёдор ли это был? "

"И кто это будет? Али я? "

"Ты или я" - всегда утверждение.

"Ты, али я? " - всегда вопрос.

Таким образом, в вашем примере пропущен знак вопроса в конце :)
"Так есть (на свете) то место, или его (на свете) нет? "

Из словаря Даля:

АЛИ, АЛЕ, АЛЬ, АЙ союз или, либо; || разве. Али то, али это. Аль ты ослеп? “Звать или не звать? ” показывает сомнение, без выражения своей мысли; “звать аль не звать? ” показывает, что говорящий полагал бы не звать. Аль тебе тесно было в чистом поле пройти, говорит раненый солдат пуле. Аль я у Бога теленка съел? Аль моя плешь наковальня? Аль тебе в лесу лесу мало? Аль в людях людей нет?

Все просто. Может есть такое место, а может и нет. Бабушки рассказывали легенды, что есть такое волшебное место... А ты хочешь верь, а хочешь не верь. Волшебное место...