Почему в России по 2-3 номера (кода) на некоторые области? например на Самарскую область коды номеров 163 и 63

Потому что на количество автомобилей номеров в пределах одной нумерации не хватает.

одного не хватает. Очень маленькая ёмкость номерного ряда. А учитывая, что номера не используются повторно, регионы с активными купле-продажами и большим количеством населения, быстро выбирают ее. В Москве их, например, уже 7 штук. В подмосковье - 5.

В Москве вообще уже вариантов 5, наверное. Больше машин, больше номеров нужно.

Не хватает одного кода региона для всех зарегистрированных в регионе ТС, ведь количество цифро-буквенных комбинаций в каждом коде региона ограничено 1726272 штуки.

Когда заканчиваются комбинации номеров на двузначном коде региона, к коду добавляется единица (или семерка) . Только эти две цифры способны поместиться в поле номера, где указан регион, без увеличения размера знака.