Как пометить все сообщения на яндекс почте, как прочитанные?!

удали все

ну так когда открываешь "входящие" там над списком, где начинаются письма - есть еще одно место свободное (где галочку можно поставить) - ставь там галочку - все письма тоже галочкой отметятся - потом указывай что они прочитанные....

Яндекс почта - в правом в верхнем углу, настройка (значок шестерёнка) - правила обработки почты.
Всё очень подробно написано.