Перпендикулярно плоскости эклиптики, вы имеете в виду? Можно. Но только с применением гравитационного маневра вблизи Юпитера. существующие ракеты не могут обеспечить характеристическую скорость порядка 30 км в секунду, которая нужна для такого запуска непосредственно с Земли. Поэтому аппарат сначала летит к Юпитеру, пролетает над его северным или южным полюсом. Притяжение Юпитера изменяет орбиту станции таким образом, что она приобретает большой наклон к эклиптике. Так "Улисс" Европейского космического агентства летал - впервые сумел благодаря этому маневру пролететь над полюсами Солнца.
Теоретически можно. Практически потребуется очень много топлива. При обычном запуске мы стартуем с движущейся в нужном направлении со скоростью 30 км/с платформы - Земли, а если лететь поперек, Земля нам не помощница, скорее наоборот.