Вообще вся процедура описана в Административном регламенте
http://otvet.mail.ru/question/5943036/Если лень ходить по ссылке и более чем 3 предложения в ответе раздражают, то :
10. При утрате паспорта гражданин представляет письменное заявление, в котором указывается, где, когда и при каких обстоятельствах был утрачен (похищен) паспорт, заявление о выдаче (замене) паспорта по форме N 1П, четыре личные фотографии установленного образца, а также квитанцию об оплате государственной пошлины.
13. Выдача и замена паспортов производятся подразделениями Федеральной миграционной службы по месту жительства, месту пребывания или по месту обращения гражданина.
64. При утрате паспорта гражданин должен незамедлительно обратиться в подразделение ФМС.
Замена паспорта при утрате осуществляется в течение 2х месяцев (п. 16).
Штраф по ссылке.
ЗЫ: Обращаться в орган внутренних дел с заявлением следует только в случае хищения паспорта, и такое заявление будет расценено как заявление об уголовном преступлении со всеми вытекающими (расследование, дача показаний, ответственность за ложный донос и пр.) . Об этом говорит и п. 63.
При обращении в подразделение ФМС с заявлением об утрате паспорт также поставят в розыск.