Вариант, предложенный Катрин, вполне разумный, но если оперативной памяти 6 гБ и больше, есть смысл использовать утилиту RAM Disk, эмулирующую в оперативной памяти полноценный хард. При правильной настройке скорость работы с временными файлами повысится в десятки раз, а при выключении компьютера папки Temp будут автоматически очищаться. Только настроить нужно не только расположение системных папок, но и аналогичных собственных папок программ.
http://ramdisk.nm.ru/ramdiskent-rus.htm