Может помочь как по отдельности, так и в совокупности:
удалить все старые драйверы телефона с помощью USBDeview, можно и другие драйверы usb, которые возможно мешают;
установить драйверы из шапки (для большинства подойдут MTK_drivers.rar);
перегрузить венду, иногда помогает в безопасный режим;
поотключать всякие антивири, брендмауеры и прочие защитники виндовс ;
батарея дб заряжена не менее чем на 50%;
подключать после нажатия кнопки в флештуле (если просто подключать, без или до команды флештула, через некоторое время аппарат может выйти из режима и продолжить загрузку);
выключенный аппарат без батареи или с ней (зависит от модели уточняйте в теме своего аппарата);
подключать прямым заведомо исправным кабелем;
подключать без всяких переходников\удлинителей и хабов;
подключать в зад ББ в порт на маме;
вставить батарею (если не вставлена);
анализировать лог flashtool (обычно C:\ProgramData\SP_FT_Logs\"Папка с датой"\SP_FLASH_TOOL.log)
попробовать\сменить другую версию SP_FlashTool (3.x<=>5.x);
если ничего не помогло, попробовать на другом компьютере.
Скачать ОФИЦИАЛЬНУЮ прошивку
Установка прошивки с ПК для смартфонов Lenovo
http://lenovo-forums.ru/topic/1249-установка-прошивки-с-пк-для-смартфонов-lenovo/