чем отличается физическая карта от карты природных зон

Наполняемость материала разная.

На физической карте показаны разные географические объекты (реки, озера, горы и др.). А на карте природных зон показаны зоны (пустыни, степи, леса, смешанные леса и др.)

На физической карте показан рельеф, а на карте природных зон показаны природные зоны