Что делать если на телефоне не читает флэш карта

То jQuery тут бессилен.
Проверить, читается ли она в PC или читает телефон другую, т. е. кто виноват. Если PC предлагает отформатировать - не делайте этого. Обратиться к более понимающим людям, если нужны данные.