По-видимому, врач ориентируется на общепринятую таблицу
http://www.prodetey.ru/tablemassamal.html . При недостаточной массе могут возникнуть разные заболевания и отставание в развитии, поэтому перестраховываются. Вам должны были назначить анализ на усвоение пищи. Если все нормально с анализами, развитием, здоровьем, возможно это индивидуальная особенность строения.