Моя сестра проживает в Израиле, она гражданка России. В 2016 году ей исполнится 45 лет, обменять паспорт в Израиле.

В консульство, пасольство РФ обратитесь

Зачем? Загран, по которому она проживает у нее действителен по сроку в нем указанному. А внутренний документ в Израиле на фиг не нужен. Приедет в РФ, сходит в отделение ФМС и обменяет, если уж сильно хочет. Диппредставительства не занимаются внутренними документами.

Внутренний паспорт РФ можно обменять только на территории РФ, но если она проживает в Израиле постоянно, то ей нет необходимости менять его до момента въезда в Россию. Посольство и консульство делают только загранпаспорта.