ВЫЙДЕТ ЛИ 3 СЕЗОН АНИМЕ БЕСКОНЕЧНЫЕ НЕБЕСА

Манга тут совершенно не при чем. Аниме IS: Infinite Stratos - это экранизация ранобэ, а не манги. Манги же по ранобэ нарисовано как минимум шесть разных тайтлов (причем все "вбоквелы"), часть из которых завершена, часть еще выходит (и будет в свое время завершена, никакого "не дорисовали" там нет).
Никаких официальных заявлений о третьем сезоне IS: Infinite Stratos не было. После выхода второго сезона прошло уже два года (год с небольшим, если посчитать и овашки). Ранобэ еще не завершены, так что вы пока можете ждать и надеяться. Только надо учитывать при этом, что чем больше проходит времени, тем менее маловероятен третий сезон.