Что значит профильный ЕГЭ по литературе?

Нет, это не означает, что литература сдается по двум профилям. Это одначает, что в общем наборе вступительных предметов главным (ведущим) для данной специальности является литература. Это будет иметь значение в каких-ьл проблемных ситуациях, например, в ситуации, если при поступлении у Вас будут набраны одинаковые с кем-то ещё баллы по трем предметам ЕГЭ, тогда предпочтение будет отдано тому, у кого выше балл по профильному (главному) предмету.