Потому что у него
гетерохромия. Это реально существующее явление (конечно, в реальности у людей не красный и желтый цвет глаз). Для мангаки это был способ показать раздвоение личности у Акаси.
P.S. Имя персонажа правильно пишется "Акаси". Сравните: "Юкио Мисима", а не "Мишима", "Сикоку", а не "Шикоку" и т. п.