про эллиптический тренажер

Перемещаться нужно мягко во время занятия. Возможно, вы просто слишком большой уровень себе ставите или программу слишком тяжелую выбираете? В любом случае, когда опускаете ногу на пятку, делать это нужно плавно, следите, чтобы стопа стояла успойчиво, шагать должны педали (или как их лучше назвать) , а не вы по их поверхности. И обязательно работайте руками, чтобы снизить нагрузку на стопы.
Возможно, кстати, нужно действительно обратить внимание на обувь. Нужны кроссовки с хорошей фиксацией ноги и амортизацией. Спросите в спортивном магазине обувь для бега, вам подскажут.