Удалять файлы не опасаясь за работоспособность Windows можно спокойно в папках "Temp", то есть в этой папке сохраняются все временные файлы, которые со временем становятся не нужны.
Во время удаления неоднократно будут появляться окна с предупреждениями, смело подтверждаем удаление, где это возможно.
С: \Temp
C:\Windows\Temp
C:\Users\ВАШЕ_ИМЯ_ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ\AppData\Local\Temp\
Но можно воспользоваться и формально более правильным способом. Откройте Свойства диска с установленной Windows и нажмите на кнопку Очистка диска. Запустится процесс сбора данных.
И откроется окно Очистка диска. В нем находим и отмечаем пункт Временные файлы, при желании ставим еще галочки где нужно, и нажимаем ОК, затем подтверждаем удаление.