Чем системный диск отличается от обычного

Тем, что комп с него грузится.

ничем, кроме того, что на нем располагается ОС.

Тем, что он горд этим фактом.

Тем, что на нем система.

На нём установлена операционная система...

На нём система установлена.

Вообще-то "системный диск" говорить не совсем корректно. Правильней говорить о "системном разделе" или даже о "системном томе" если разделы динамические.
На самом деле - не самый лёгкий вопрос. Дело в том, что разные источники трактуют понятия "системный раздел" и "загрузочный раздел" по разному, меняя их между собой и путая.
Скажем, Майкрософт называет "системным" раздел, где хранятся файлы для загрузки системы, а "загрузочным" тот, где расположена папка WINDOWS.
ИМХО, это неправильно, но кто такой я и кто такой Майкрософт. :-D
Дело в том, что эти файлы могут располагаться на разных разделах и даже на разных дисках.
Правильней было бы наоборот считать системным раздел, где расположены системные файлы, а загрузочным тот, где лежат файлы, необходимые для загрузки. И в большинстве источников с этим согласны (И я тоже).
Так что выбирайте сами.

PS: И да, кстати. Системный раздел может быть одновременно загрузочным. А может и не быть.