Почему в некоторых языках слова пишутся не так как читаются?

Язык развивается, меняется. Вслед за ним меняется и письмо, но не сразу, а с задержкой в одно столетие или больше.

Раньше из-за менее развитой/тренированной анатомии голосового аппарата и голосовых отделов мозга произношение было (?) проще и ближе к животному миру.

Например, в конце слов, оканчивающихся на согласные, обычно ставилась "смазка" в виде гласного звука. Потому что древний человек не мог выговорить последовательность слов, оканчивающихся на согласные.

Примерно со времён Ломоносова эта "смазка" в русском (но не украинском) языке стала постепенно исчезать. Но соответствующая ей буква оставалась аж до революции.

Сегодня тоже многие звуки наполовину или на три четверти исчезли. Но следы их в устной речи остались, Например, "смазка" в слове "мышь" (в отличие от "камыш").

Умение чувствовать эту "смазку" и отмечать её на письме отдельной буквой считалось и считается "высшим пилотажем", - признаком образованности и интеллекта)

Вроде.

Вот, например, окончание "го" вместо "во". Хотя мы говорим "во" ("ево топор"), но там есть неуоловимый остаток древнего произношения "яго топор".

)