Почему фраза yes of cource С предлогом -of ?

course - курс, ход. of - предлог притяжательного падеже. of course = по ходу = согласно заведённому ходу вещей, само собой разумеется, конечно, как заведено (полный смысловой эквивалент).
O'clock = of clock = по часам. 5 o'clock - пять по часам - пять на циферблате часов ("пять часов" = 5 clocks/watches).