Можно ли масштабировать систему координат так: 1 деление по оси икс не равен одному делению по оси y.

Вполне.

Конечно можно,

Для удобства, чтобы, например, график поместился полностью, это часто делают. Даже одна из осей может быть с переменной шкалой, например, с логарифмической

масштабы могут быть разными, только каждую ось обязательно разбить на деления и каждое деление подписать

Масштабируй, как хочешь.