применяются ли сейчас в армии пистолеты-пулемёты или их полностью вытеснили штурмовые винтовки?

Зависит от типа армии. В пост-советских не применяются, в западных, где есть определенная свобода выбора оружия, особенно у элитных подразделений, применяются. Главным образом это MP5.