Как наложить фильтр на анимацию .gif (Photoshop)?

Да просто, взят и накласть.

Это зависит от того, какой фильтр ты хочешь "наложить"

Пакетная обработка через меню File | Automate | Batch (Файл-Автоматизация-Пакетная обработка) в рабочей среде Фотография. потом перейти в Анимацию и собрать ГИФ заново

Час от часу не легче!!!!
Объединить слои можно щёлкнув по верхнему ПКМ в меню выбрать объединить видимые.
Перед этим все слои необходимо сделать видимыми, нажав на глаз слева от каждого.
Есть одно "НО"!

На самый верхний слой -- Редактирование - коррекция - цветовой фон. насыщенность (или чё ты там хочешь) без обтравочной маски (то есть ко всем слоям)! Применится ко всей анимации

Слой аджасмент создай