Удержание НДФЛ при перечислении арендной платы по договору аренды недвижимости:
доход, который получен физическим лицом - налоговым резидентом РФ, не являющимся индивидуальным предпринимателем, от сдачи в аренду находящейся в РФ недвижимости, признается объектом обложения и учитывается при определении налоговой базы по НДФЛ (пп. 4 п. 1 ст. 208, п. 1 ст. 209, п. 1 ст. 210 НК РФ). Организация, которая арендует объект недвижимости у физического лица (в том числе у своего работника) и выплачивает ему арендную плату, обязана в качестве налогового агента исчислить, удержать у физического лица и уплатить в бюджет НДФЛ с суммы такого дохода (п. п. 1, 2 ст. 226 НК РФ) <*>. Аналогичный вывод следует, например, из Писем Минфина России от 27.08.2015 N 03-04-05/49369, от 02.06.2015 N 03-04-06/31829. Исчисление НДФЛ с дохода арендодателя - физического лица, являющегося налоговым резидентом РФ, производится по налоговой ставке 13 процентов (п. 1 ст. 224 НК РФ).
http://www.consultant.ru/cons/cgi/online.cgi?req=doc;base=PPS;n=11;dst=100057#0*
Так можно сдавать, если одна организация снимает на длительный срок для одного своего сотрудника квартиру -на год и более.
А если решите сдавать в аренду квартиру разным командированным на постоянной основе, то во-первых эту деятельность ФНС может признать предпринимательской с начислением налогов. Во-вторых на короткий срок или посуточно никто из командированных ее не снимет, если им нужны документы. Платить за вас еще 13 % ндфл дураков нет. Бывает зачастую наоборот -вы об наличиваете, а не они за вас еще налоги должны платить.