Для чего эти отверстия?

Это значит, что по проекту над последним жилым этажом есть ещё один, технический этаж. Он очень низкий и пропорций фасада не нарушает. Отверстия - его окна для вентиляции и естественного освещения. И таки да, там живут птицы и очень мешают обслуживанию коммуникаций дома.