Какой кодек использовать при рендере в After Effects

Без компрессии надо

а это смотря что дальше делать будешь. Если куда то вставлять - лучше uncompress. Если вставлять с прозрачностью - QuickTime PNG. Если смотреть - H.264.

Я в Н. 264 делаю

.MOV,Н. 264