Какие деньги от клиентов могут не учитываться при расчете налога?

Если под клиентом вы имеет в виду покупателя или заказчика, а не поставщика, то задаток (ст. 251 НК), возврат займа, возврат кредита-основного долга, а не процентов (если только ваша организация является банком).