нужно ли платить налог при продаже квартиры в данной ситуации?

Вы получили 1090000 -- это ваш доход. Вы имеете право уменьшить ваш налогооблагаемый доход на сумму документально подтвержденных расходов на покупку этой квартиры. Т. е. если у вас есть документы на 1300000, вы из 1090000 вычитаете 1300000 и получаете не отрицательное число, как можно было бы подумать, а 0 налогооблагаемого дохода. Сделать это нужно в декларации 3-НДФЛ, приложить к ней все подтверждающие документы и отправить/принести в налоговую. Декларация заполняется самостоятельно или у специально обученных людей за достаточно небольшое вознаграждение.