Квартирмейстер - командир абордажной команды или распределитель жилья на пиратском корабле?

Первое.
Квартирмейстер был, пожалуй, в чем-то круче капитана. Потому что вел абордажную команду в бой. Трусов там не держали.

Квотермейстер, чувак. Небось Веллера начитался?

«Когда я был квартирмейстером, старые пираты Флинта слушались меня, как овечки. Ого-го-го, какая дисциплина была на судне у старого Джона!» — «Остров сокровищ», глава 11

«... этот чин присутствует и на военном флоте, но рассмотрим мы его исключительно в контексте пиратской команды.

Как и капитана, его выбирала команда.
Квартирмейстер у пиратов был вторым лицом на корабле и следил за порядком в общей повседневной жизни на борту.
Квартирмейстер на пиратском корабле должен был обладать непоколебимым авторитетом, поскольку именно ему приходилось улаживать возникающие конфликты и следить за выполнением приказов капитана.
Если шла речь о наказании за мелкие проступки, то именно квартирмейстер выступал в роли судьи.
Если совершалось серьезное нарушение, экипаж и капитан выступали в качестве суда присяжных, а судьей опять-таки был квартирмейстер. Обычно именно ему команда давала право руководить поркой матросов.

При захвате судна квартирмейстер шел в авангарде абордажной команды, а после успешного захвата следил за тем, чтобы при разделе награбленного каждый согласно установленному уставу получил причитающуюся ему сумму»...