Что делать с цветками, яблоней?

А зачем с ними что-то делать?

Видимо Вы хотели спросить как сохранить цветы в зимний период и яблоки? Если погода уже не позволяет оставлять яблоки на дереве, лучше собрать и часть переработать, часть заложить на хранение если есть помещение для этого. Цветы выкопать, очистить от земли, и такие как георгины или канны, мирабилис, подсушить, потом заложить в ящик или мешок и пересыпать песком. Гладиолусы выкопать, наполовину срезать цветонос и просушить. После просушки ещё раз подрезать, оставив пеньки до 5 см. длиной и свободно положить в картонную коробку, например из под обуви. Хранить в прохладном сухом помещении, можно например под шкафом.

С однолетних - собрать семена, многолетники обрезать, яблоню очистить от плодов .

Ничего. Я так понимаю, яблоня зацвела? Ничего страшного.