Снижает ли usb хаб скорость подключенных к нему накопителей?

Да, снижает. Величина снижения зависит от конкретной марки и модели хаба. Системный хаб напрямую подключен к южному мосту материнской платы, а все внешние хабы подключаются уже к системному хабу. Поэтому поток команд и данных проходит через два контроллера, и чем больше разница в их производительности, тем большая будет задержка.
Кроме того на производительность может влиять сила тока, передаваемого на устройство. Если хаб пассивный (без блока питания), то силы тока будет недостаточно для стабильной работы подключенного жесткого диска. Этот пункт актуален для внешних жестких дисков USB2 (многие корпуса для HDD стандарта USB2 имеют два разъема для подключения к компьютеру как раз для повышения силы тока). В стандарте USB3 силу тока подняли, но если к одному порту подключено много потребителей через хаб, то все равно может наблюдаться недопитка. SSD и флешки этой проблемы во многом лешены, т. к. требуют меньшего тока для своего питания.