Можно ли обезжирить поверхность чипа процессора перед нанесением термопары водкой ?

Нельзя. Но если других вариантов нет, то можно. Только следует понимать, что водка является, даже если она действительно очищенная, содержит очень много примесей, содержащих сивушные масла или отдушки. Для хорошего эффекта обезжиривания металла не подходит.
По той же причине не подходит и одеколон.
Даже "чистый" спирт лучше использовать "для протирки контактов".
А вот для пайки или действительно полной удалении следов загрязнений, в радиоэлектронике применяется специализированные средства, имеющие высокие показатели. Если вам важен результат, используйте рекомендованные производителем материалы для ухода за электроникой
https://www.ruselectronic.com/khimija-dlja-eljektronshchika/
3)Ацетон. самый доступный в продаже.
4)Дигризер 65 CRC. спрей
7)Изопропанол, изопроиловый спирт
9)Бензин «Калоша», нефрас

Только верно спросили, "зачем вообще так тщательно зачищать место прилегания термопары?". Ведь в этом случае имеет значение сила прижимания. Даже, если есть возможность, лучше винтами затянуть контакт, чтобы улучшить термообмен
http://forum.ixbt.com/topic.cgi?id=30:19434
https://forum.sources.ru/index.php?showtopic=399983

Обязательно вынимайте вилку из розетки, когда лезете внутрь электроники!

Фунфырики ещё никто не отменял. Брал за 35 рублей. Обезжиривает превосходно

Можно

Зачем вообще обезжиривать?