Как правильно снять с баланса предприятия забор в промзоне ( в Росреестре он не зарегистрирован).

Привлечь подрядную организацию или группу рабочих, заключить договор на выполнение работ, по окончании работ оформляете акт выполненных работ. На основании акта выполненных работ составляется бухгалтерская справка о ликвидации объекта и снятии с учета.
Если предприятие силами своих рабочих уберет забор, то для начала издать приказ, в котором указывается кто и что должен сделать, кто является бригадиром и ответственным за производство работ. По окончании работ бригадир составляет отчет о выполненных работах, далее бухгалтерская справка.
Но имейте в виду, что забор не превратится в воздух, он превратится либо в стройматериалы, которые пойдут на склад, либо превратится в отходы, которые следует разместить на полигоне. И тогда налоговики не смогут придраться, что это мнимые работы, которых не было, а только хотели лишние расходы придумать себе в карман