в каких магазинах продаются чашки Петри? можно ли купить их в аптеке?

Аптека -вряд ли... Никто же из покупателей аптек не занимается выращиванием культур бактерий.
Есть специализированные магазины медицинской техники, или аналитического оборудования, там смотреть надо.

Скорее всего в специализированных магазинах. Я сама не покупала. Но было такое, что работала в лабораториях лицея. А потом в лабораториях научного центра. Там все есть. Поэтому не интересовалась вопросом. Возможно, лучше заказать в Интернете