А чем отличается фраза "имело смысл" от фразы "возымело смысл"?

Правописанием

имело смысл, но сейчас не имеет, а что-то не имело, но вдруг возымело.

"возымело" - сначала казалось бессмысленным, но потом оказалось, что в этом есть смысл

Вообще-то, слова ИМЕТЬ и ВОЗЫМЕТЬ имеют совершенно разное значение.

"Имеет смысл" - широко используемое выражение, означает то же самое, что "есть смысл",

Имеет смысл сначала раздобыть деньги, а потом уже идти в бордель.
"Возымело смысл" - не думаю, что существует такое выражение.

Заглянем в толковый словарь:
ВОЗЫМЕТЬ - В сочетании с существительными желание, охота, намерение и т. п. обозначает наступление состояния, чувства и т. д., выраженного этим существительным.
Примеры: Возымел намерение отправиться в путешествие.
Вот и я возымел охоту к расширению русской промышленности.
По окончании спектакля он возымел желание с ним познакомиться.

Второе сочетание не существует, а потому неграмотно.

https://dic.academic.ru/searchall.php?SWord=Возыметь&from=xx&to=ru&did=&stype=

Иметь смысл.
Возыметь мысль. Мысль, а не смысл