Почему в магазинах скидки бывают большие на хороший товар, это же невыгодно продавцам

Почему не выгодно?
Есть так называемые товары "паровозы", которые продаются с небольшой маржинальностью, а иногда и в убыток. В строяке, например, это Ротбанд или Гипсокартон, зато свою прибыль на Вас продавец поимеет продав Вам к этому всему крепеж, направляющие и т. п..
В обычных магазинах, есть писок продуктов по которым Вы оцениваете насколько товар в магазине "дешевый", вот на него занижают цены или делают скидки.

Также скидки делают на товар предыдущей коллекции, который требуется заменить на новую. Он хороший, но прошлогодний. :))

Ну и планы никто не отменял. если поставщик требует оборот, чтобы давать ту же самую скидку, то можно и в ноль продать, лишь бы ее сохранить.

Я не говорю уже о более сложных играх по выдавливанию конкурента с рынка или банальный слив остатков, когда уходишь с этого рынка.