Есть ли разница между загрузочной флешкой форматированной как FAT32 и загрузочной флешкой форматированной как NTFS ?

FAT32 (от англ. File Allocation Table — «таблица размещения файлов» ) — это файловая система, разработанная компанией Майкрософт, разновидность FAT.
FAT32 является последней версией файловой системы FAT и улучшением предыдущей версии, известной как FAT16. Она была создана, чтобы преодолеть ограничения на размер тома в FAT16, позволяя при этом использовать старый код программ MS-DOS и сохранив формат. FAT32 использует 32-разрядную адресацию кластеров. FAT32 появилась вместе с Windows 95 OSR2.
Теоретически, FAT32 может поддерживать примерно 268 435 438 кластеров, позволяя использовать жёсткие диски объёмом примерно 2 ТБ. Однако, из-за ограничений в утилите ScanDisk (точнее, из-за того, что Windows 98 не поддерживает режим LBA48, а только LBA28), FAT32 ограничен размером примерно в 124,55 ГБ. Windows 2000 и Windows XP могут создавать разделы FAT32 размером не более 32 ГБ, в то время как другие версии не имеют такого ограничения; причины этого не ясны.
Максимально возможный размер файла для тома FAT32 — 4 ГБ – 1 байт (232–1 байт) . FAT32 не поддерживает установку разрешений на доступ к файлам и папкам и некоторые другие функции современных файловых систем. Все эти причины привели к тому, что сейчас наблюдается тенденция отказа от FAT32 в пользу более продвинутой файловой системы NTFS.
NTFS (от англ. New Technology File System — «файловая система новой технологии» ) — стандартная файловая система для семейства операционных систем Microsoft Windows NT (Windows 2000, Windows XP, Windows Server 2003, Windows Vista).
NTFS заменила ранее использовавшуюся в MS-DOS и ранних версиях Windows файловую систему FAT. NTFS поддерживает систему метаданных и использует специализированные структуры данных для хранения информации о файлах для улучшения производительности, надёжности и эффективности использования дискового пространства. NTFS имеет встроенные возможности разграничивать доступ к данным для различных пользователей и групп пользователей, а также назначать квоты (ограничения на максимальный объём дискового пространства, занимаемый теми или иными пользователями) . NTFS использует систему журналирования для повышения надёжности файловой системы.
Различают несколько версий NTFS: v1.2 используется в Windows NT 3.51 и Windows NT 4.0, v3.0 поставляется с Windows 2000, v3.1 — с Windows XP и Windows Server 2003. Иногда последние версии обозначают как v4.0, v5.0 и v5.1 в соответствии с версиями Windows, с которыми они поставляются